但这里另有一问题，隋、唐以下宋、元、明、清一千年来的近代中国，有些时，其衰乱情况，更甚于隋、唐之前，但何以此千年来的宗教势力，却永远不再抬头，永不能再如魏晋南北朝时代的风靡日照？只如金、元时代黄河流域的全真教，虽亦一时获得社会上群众的归附，但到底没有把握到学术思想上的领导权。断不能和魏晋南北朝时代的佛教相拟。这里自然另有一些原因，值得我们叙述。
原来佛教思想传入中国，早已逐步的中国化了。尤其是晚起的禅宗。他们的理论，主张“自性自修，自性迷即众生，自性悟即是佛”。又说：“万法尽在自心，从自心中顿见真如本性”。他们常劝人在家修行，见取自性，直成佛道。实在他们已完全脱落了宗教的蹊径。一切归依自性，尚何宗教可言。“识心见性，自成佛道”，便何异儒家“尽心知性，尽性知天”的理论。禅宗只把儒家的“天”字“圣”字换成“佛”字，其他完全一样要从自心自性上认取。因此一到禅宗思想出世，各人都回头到自己心性上来，不再有所谓西方佛法要向外追求。那时的佛教精神，早已为平民社会日常人生所融化。所以说：“无明即真如，烦恼即菩提，轮回即涅槃”。这无异于说：一切尘世俗界，即是佛土天堂了。