鹿钟麟旋被免职,军事委员会以第一战区司令长官卫立煌兼任冀察战区(实为冀、鲁、豫三省边区)总司令。庞炳勋接替河北省政府主席职。朱怀冰军、孙殿英军退至晋豫边区后与庞炳勋军会合,编为第24集团军,庞任总司令,驻陵川、林县一带,以太行山为根据地,对平汉铁路、道清铁路游击,于5月至11月间击退日军数次进攻。1940年12月4日,因石友三企图叛变,高树勋奉命将其逮捕处决。原石友三部孙良诚军与高树勋军合编为第39集团军,以卫立煌兼任总司令,孙良诚、高树勋为副。后孙良诚被俘,高树勋继任总司令,高部退至鲁西东明、濮县,以濮阳为根据地,继续游击。至此,冀察战区已名存实亡。
(二)鲁苏战区
1939年3月,鲁苏战区成立,以于学忠为总司令,韩德勤、沈鸿烈任副总司令。于学忠率牟中珩军进驻沂蒙山区,另调苏北缪澂流军进驻日照西北山区,归于直接指挥。军事委员会划定长江以北、津浦铁路以东、老黄河以南,为鲁苏游击战区。鲁苏战区兵力主要为鲁南缪澂流军、苏北李守维军(韩德勤部)、牟中珩军(于学忠部)、李仙洲军和新编第4师(吴化文)、新编第36师、暂编第12师、暂编第55师。战区副总司令、山东省政府主席沈鸿烈指挥新编第4师(亦称“保安师”)及山东保安团队,主要根据地为莒县、蒙阴地区,总部驻沂水西之高湖。战区副总司令兼第24集团军总司令、江苏省政府主席韩德勤指挥第89军及苏北保安团,以苏北淮阴、宝应、高邮、兴化为根据地,总部驻兴化。战区所辖正规军共约10余万人,游击队及保安团队共约15万余人。